Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRC1O43663 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRC1O43663 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRC1O43663 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRC1O43663 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRC1O43663 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRC1O43663 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRC1O43663 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRC1O43663 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRC1O43663 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRC1O43663 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRC1O43663 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRC1O43663 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRC1O43663 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRC1O43663 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRC1O43663 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRC1O43663 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRC1O43663 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRC1O43663 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRC1O43663 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRC1O43663 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRC1O43663 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRC1O43663 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRC1O43663 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRC1O43663 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRC1O43663 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRC1O43663 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRC1O43663 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRC1O43663 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRC1O43663 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRC1O43663 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRC1O43663 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRC1O43663 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRC1O43663 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRC1O43663 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRC1O43663 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRC1O43663 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRC1O43663 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRC1O43663 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRC1O43663 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRC1O43663 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRC1O43663 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRC1O43663 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRC1O43663 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRC1O43663 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRC1O43663 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRC1O43663 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRC1O43663 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRC1O43663 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRC1O43663 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRC1O43663 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRC1O43663 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRC1O43663 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRC1O43663 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRC1O43663 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRC1O43663 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRC1O43663 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRC1O43663 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRC1O43663 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRC1O43663 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRC1O43663 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRC1O43663 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRC1O43663 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRC1O43663 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRC1O43663 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRC1O43663 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRC1O43663 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRC1O43663 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRC1O43663 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRC1O43663 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRC1O43663 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRC1O43663 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRC1O43663 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRC1O43663 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRC1O43663 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRC1O43663 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRC1O43663 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRC1O43663 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRC1O43663 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRC1O43663 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRC1O43663 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRC1O43663 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRC1O43663 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRC1O43663 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRC1O43663 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRC1O43663 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRC1O43663 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRC1O43663 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRC1O43663 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRC1O43663 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRC1O43663 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRC1O43663 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRC1O43663 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRC1O43663 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRC1O43663 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRC1O43663 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRC1O43663 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRC1O43663 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRC1O43663 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRC1O43663 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms