Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8B1O43520 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms