Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms