Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF3O43395 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF3O43395 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms