Protein–RNA interactions for Protein: O43309

ZSCAN12, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN12O43309 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZSCAN12O43309 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSCAN12O43309 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms