Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GPAA1O43292 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPAA1O43292 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms