Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYNMO15061 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYNMO15061 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
SYNMO15061 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYNMO15061 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYNMO15061 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYNMO15061 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYNMO15061 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYNMO15061 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
SYNMO15061 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYNMO15061 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYNMO15061 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
SYNMO15061 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYNMO15061 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYNMO15061 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYNMO15061 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYNMO15061 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYNMO15061 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SYNMO15061 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
SYNMO15061 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SYNMO15061 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SYNMO15061 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SYNMO15061 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SYNMO15061 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SYNMO15061 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SYNMO15061 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SYNMO15061 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SYNMO15061 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SYNMO15061 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
SYNMO15061 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SYNMO15061 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
SYNMO15061 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
SYNMO15061 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SYNMO15061 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SYNMO15061 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SYNMO15061 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SYNMO15061 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
SYNMO15061 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SYNMO15061 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SYNMO15061 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYNMO15061 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SYNMO15061 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYNMO15061 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYNMO15061 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYNMO15061 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYNMO15061 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SYNMO15061 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYNMO15061 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYNMO15061 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYNMO15061 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYNMO15061 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYNMO15061 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYNMO15061 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYNMO15061 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYNMO15061 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
SYNMO15061 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYNMO15061 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYNMO15061 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYNMO15061 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYNMO15061 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
SYNMO15061 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYNMO15061 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
SYNMO15061 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYNMO15061 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYNMO15061 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYNMO15061 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYNMO15061 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYNMO15061 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
SYNMO15061 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYNMO15061 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYNMO15061 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYNMO15061 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYNMO15061 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYNMO15061 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYNMO15061 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYNMO15061 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYNMO15061 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SYNMO15061 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SYNMO15061 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYNMO15061 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYNMO15061 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYNMO15061 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYNMO15061 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYNMO15061 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SYNMO15061 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYNMO15061 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYNMO15061 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYNMO15061 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYNMO15061 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYNMO15061 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
SYNMO15061 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYNMO15061 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SYNMO15061 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SYNMO15061 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SYNMO15061 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SYNMO15061 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
SYNMO15061 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
SYNMO15061 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYNMO15061 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYNMO15061 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms