Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRNO00468 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRNO00468 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRNO00468 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRNO00468 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRNO00468 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRNO00468 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRNO00468 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRNO00468 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRNO00468 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRNO00468 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRNO00468 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRNO00468 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRNO00468 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRNO00468 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRNO00468 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRNO00468 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRNO00468 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRNO00468 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRNO00468 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRNO00468 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRNO00468 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRNO00468 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRNO00468 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRNO00468 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRNO00468 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRNO00468 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRNO00468 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRNO00468 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGRNO00468 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRNO00468 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRNO00468 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRNO00468 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRNO00468 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRNO00468 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRNO00468 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRNO00468 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRNO00468 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRNO00468 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRNO00468 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRNO00468 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRNO00468 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRNO00468 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRNO00468 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRNO00468 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRNO00468 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRNO00468 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRNO00468 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRNO00468 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRNO00468 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRNO00468 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRNO00468 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRNO00468 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRNO00468 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRNO00468 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRNO00468 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRNO00468 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRNO00468 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRNO00468 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRNO00468 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRNO00468 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRNO00468 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRNO00468 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRNO00468 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRNO00468 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRNO00468 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRNO00468 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRNO00468 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRNO00468 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRNO00468 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRNO00468 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRNO00468 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms