Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PIK3C2AO00443 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3C2AO00443 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms