Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NFKBIEO00221 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NFKBIEO00221 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFKBIEO00221 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms