Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC188H7C350 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC188H7C350 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC188H7C350 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC188H7C350 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC188H7C350 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC188H7C350 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC188H7C350 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC188H7C350 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC188H7C350 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC188H7C350 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC188H7C350 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC188H7C350 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC188H7C350 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC188H7C350 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC188H7C350 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC188H7C350 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC188H7C350 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC188H7C350 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC188H7C350 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC188H7C350 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC188H7C350 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC188H7C350 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC188H7C350 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC188H7C350 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC188H7C350 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms