Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3BNH8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3BNH8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3BNH8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3BNH8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3BNH8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3BNH8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3BNH8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3BNH8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3BNH8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3BNH8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3BNH8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3BNH8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3BNH8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3BNH8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3BNH8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
H3BNH8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3BNH8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H3BNH8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H3BNH8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H3BNH8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H3BNH8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H3BNH8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H3BNH8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H3BNH8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H3BNH8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H3BNH8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H3BNH8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H3BNH8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H3BNH8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H3BNH8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H3BNH8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H3BNH8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H3BNH8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H3BNH8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H3BNH8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
H3BNH8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H3BNH8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H3BNH8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H3BNH8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H3BNH8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H3BNH8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H3BNH8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H3BNH8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H3BNH8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3BNH8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3BNH8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3BNH8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3BNH8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3BNH8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3BNH8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3BNH8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3BNH8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3BNH8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3BNH8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
H3BNH8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3BNH8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3BNH8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3BNH8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3BNH8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3BNH8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H3BNH8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3BNH8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3BNH8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3BNH8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3BNH8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3BNH8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3BNH8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3BNH8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3BNH8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3BNH8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3BNH8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3BNH8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
H3BNH8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3BNH8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3BNH8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3BNH8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3BNH8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3BNH8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3BNH8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3BNH8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3BNH8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H3BNH8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H3BNH8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H3BNH8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H3BNH8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H3BNH8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H3BNH8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H3BNH8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
H3BNH8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
H3BNH8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H3BNH8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H3BNH8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H3BNH8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H3BNH8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H3BNH8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H3BNH8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H3BNH8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H3BNH8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H3BNH8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms