Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PBE3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PBE3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PBE3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PBE3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PBE3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PBE3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PBE3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PBE3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PBE3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PBE3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PBE3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PBE3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PBE3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PBE3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PBE3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PBE3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PBE3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PBE3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PBE3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PBE3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PBE3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PBE3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PBE3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PBE3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PBE3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PBE3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PBE3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E9PBE3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PBE3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PBE3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PBE3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PBE3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PBE3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PBE3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PBE3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PBE3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PBE3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PBE3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PBE3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PBE3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PBE3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PBE3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PBE3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PBE3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PBE3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E9PBE3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E9PBE3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E9PBE3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E9PBE3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E9PBE3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E9PBE3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E9PBE3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E9PBE3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
E9PBE3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E9PBE3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E9PBE3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
E9PBE3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
E9PBE3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
E9PBE3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
E9PBE3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
E9PBE3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E9PBE3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
E9PBE3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
E9PBE3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
E9PBE3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E9PBE3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E9PBE3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E9PBE3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PBE3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PBE3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PBE3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PBE3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PBE3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PBE3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PBE3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PBE3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PBE3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PBE3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PBE3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PBE3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PBE3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PBE3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PBE3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PBE3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PBE3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PBE3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PBE3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PBE3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PBE3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E9PBE3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E9PBE3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E9PBE3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E9PBE3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
E9PBE3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E9PBE3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E9PBE3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E9PBE3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E9PBE3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E9PBE3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms