Protein–RNA interactions for Protein: D6RJB6

USP17L20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L20D6RJB6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L20D6RJB6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L20D6RJB6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L20D6RJB6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L20D6RJB6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L20D6RJB6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L20D6RJB6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L20D6RJB6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L20D6RJB6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L20D6RJB6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP17L20D6RJB6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L20D6RJB6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms