Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP17L13C9JLJ4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L13C9JLJ4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L13C9JLJ4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L13C9JLJ4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L13C9JLJ4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L13C9JLJ4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L13C9JLJ4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L13C9JLJ4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L13C9JLJ4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L13C9JLJ4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms