Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGTLC3B5MD39 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGTLC3B5MD39 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms