Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms