Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms