Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEURL1BA8MQ27 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms