Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
WASHC1A8K0Z3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
WASHC1A8K0Z3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
WASHC1A8K0Z3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
WASHC1A8K0Z3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WASHC1A8K0Z3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WASHC1A8K0Z3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WASHC1A8K0Z3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms