Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3P2A8K0S8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms