Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDR42E2A6NKP2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms