Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85CA6NKD9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC85CA6NKD9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms