Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC10BA6NIK2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC10BA6NIK2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms