Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf60A6NFR6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms