Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L3A6NEY3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms