Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GOLGA6L4A6NEF3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6L4A6NEF3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms