Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00862A6NCI5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00862A6NCI5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms