Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MAP1LC3B2A6NCE7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MAP1LC3B2A6NCE7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms