Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
EFCAB5A4FU69 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
EFCAB5A4FU69 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
EFCAB5A4FU69 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms