Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMB4A4D0S4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms