Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.33■■□□□ 1
HMX2A2RU54 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HMX2A2RU54 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HMX2A2RU54 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMX2A2RU54 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMX2A2RU54 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMX2A2RU54 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMX2A2RU54 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMX2A2RU54 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HMX2A2RU54 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HMX2A2RU54 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HMX2A2RU54 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMX2A2RU54 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HMX2A2RU54 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HMX2A2RU54 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMX2A2RU54 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMX2A2RU54 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMX2A2RU54 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMX2A2RU54 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HMX2A2RU54 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms