Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPDC1A2A3K4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms