Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYCE3A1L190 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCE3A1L190 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms