Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRGMA1A4Y4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms