Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms