Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YYE9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YYE9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YYE9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YYE9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YYE9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YYE9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YYE9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YYE9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YYE9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
A0A0J9YYE9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
A0A0J9YYE9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
A0A0J9YYE9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
A0A0J9YYE9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YYE9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms