Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms