Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 MANBA-201ENST00000226578 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 RAD51-202ENST00000382643 1588 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 RAMP2-AS1-205ENST00000592670 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 EXD2-206ENST00000409949 2688 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 ZNF610-201ENST00000321287 2150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 FGF11-202ENST00000572907 2358 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 INTS14-202ENST00000420799 1741 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 SIRT4-201ENST00000202967 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 OR52M1-201ENST00000360213 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 PRDX1-203ENST00000372079 609 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 HBD-202ENST00000380299 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 ACTR3-202ENST00000415792 676 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AC004980.2-201ENST00000423648 497 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AC073370.1-201ENST00000441348 525 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AP000350.1-201ENST00000443377 532 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AC078962.1-201ENST00000444853 281 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 ARHGEF19-AS1-201ENST00000457809 439 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 KRT42P-203ENST00000458343 671 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 SOX2-OT-201ENST00000460739 609 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 TUBB8P3-201ENST00000510182 803 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 LINC00290-201ENST00000512487 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 C10orf113-202ENST00000534331 579 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AC104041.1-202ENST00000560097 566 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 NARF-IT1-201ENST00000584012 769 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 ZNF551-202ENST00000596085 469 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 LINC02255-201ENST00000619758 199 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 NOP16-210ENST00000619979 963 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 CNTROB-201ENST00000380262 3769 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 C17orf51-201ENST00000391411 7914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 TNS2-210ENST00000549700 4525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 ZMYND11-205ENST00000381607 3898 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 PLSCR4-202ENST00000383083 3033 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 ZFYVE27-207ENST00000423811 3045 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 ZSCAN2-204ENST00000358472 3231 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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PTPRJQ12913 EHMT1-221ENST00000629335 3600 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 RGS3-204ENST00000350696 4387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 SDCCAG8-201ENST00000366541 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 MRS2-203ENST00000378386 3313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 WDR37-201ENST00000263150 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 TAF5L-203ENST00000366675 4062 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 SEC61A1-201ENST00000243253 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 ATP1A3-208ENST00000545399 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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PTPRJQ12913 PDPN-211ENST00000617617 2808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 TRIM23-203ENST00000381018 1855 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 SEMA4A-203ENST00000368284 2981 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PTPRJQ12913 ATP1A1-AS1-201ENST00000369491 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 LYG2-203ENST00000409679 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PTPRJQ12913 AC002070.1-203ENST00000509470 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PTPRJQ12913 AC113208.3-201ENST00000637356 2523 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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PTPRJQ12913 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AC008132.1-203ENST00000412938 5920 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 ANKRD22-201ENST00000371930 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 USP17L4-201ENST00000526929 1593 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 USP17L1-201ENST00000529559 1593 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 USP17L3-201ENST00000530484 1593 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 PDE4C-210ENST00000597297 1559 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 TFIP11-202ENST00000407148 2789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 NMNAT2-201ENST00000287713 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 PDE9A-211ENST00000398232 1885 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 CWH43-204ENST00000513409 2390 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AL031686.1-201ENST00000472805 3876 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 MAP10-201ENST00000418460 3516 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AL121900.1-201ENST00000428285 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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