Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 ADPRH-204ENST00000478399 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 NEFM-204ENST00000518131 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 IL10RA-201ENST00000227752 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 GOSR2-231ENST00000640007 1425 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 IMMT-207ENST00000449247 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 TMC2-201ENST00000358864 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 CHEK1-201ENST00000278916 1712 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 ZSCAN5A-205ENST00000587340 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 SARDH-207ENST00000439388 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 CLEC4F-202ENST00000426626 2012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 CST2-201ENST00000304725 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 FAM96A-202ENST00000380290 826 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 AC019294.1-201ENST00000395215 1184 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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PTPRJQ12913 KRBOX1-203ENST00000426937 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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PTPRJQ12913 STYXL1-206ENST00000431581 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 AC106875.1-202ENST00000435175 1170 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 CHIA-207ENST00000451398 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 PFN1P10-201ENST00000455962 327 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
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PTPRJQ12913 KRT19P3-201ENST00000507547 828 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
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PTPRJQ12913 AC069234.1-201ENST00000542620 583 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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PTPRJQ12913 C14orf2-208ENST00000554713 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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PTPRJQ12913 AL390728.4-202ENST00000606173 430 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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PTPRJQ12913 Metazoa_SRP.79-201ENST00000610676 290 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
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PTPRJQ12913 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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PTPRJQ12913 CEP83-203ENST00000397809 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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PTPRJQ12913 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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PTPRJQ12913 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 NONO-202ENST00000373841 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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PTPRJQ12913 AC115102.1-201ENST00000558044 487 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 AC012236.1-202ENST00000558388 1024 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 AL356423.1-201ENST00000604953 538 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 LINC00694-202ENST00000634610 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 MIR941-1-201ENST00000636396 72 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 CHMP2B-201ENST00000263780 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 AL606970.1-201ENST00000445442 2559 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 JMJD7-PLA2G4B-202ENST00000382448 3331 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 DCTN2-201ENST00000434715 1677 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 KCNMA1-289ENST00000640807 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 RGN-201ENST00000336169 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPRJQ12913 AL583844.1-201ENST00000424229 1724 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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