Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Z0

BACE2, Beta-secretase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE2Q9Y5Z0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE2Q9Y5Z0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BACE2Q9Y5Z0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BACE2Q9Y5Z0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BACE2Q9Y5Z0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BACE2Q9Y5Z0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms