Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX8Q9Y5X2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms