Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms