Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q5

LAMTOR2, Ragulator complex protein LAMTOR2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR2Q9Y2Q5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMTOR2Q9Y2Q5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMTOR2Q9Y2Q5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMTOR2Q9Y2Q5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMTOR2Q9Y2Q5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMTOR2Q9Y2Q5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR2Q9Y2Q5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR2Q9Y2Q5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR2Q9Y2Q5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR2Q9Y2Q5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR2Q9Y2Q5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR2Q9Y2Q5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR2Q9Y2Q5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR2Q9Y2Q5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR2Q9Y2Q5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR2Q9Y2Q5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR2Q9Y2Q5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR2Q9Y2Q5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR2Q9Y2Q5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR2Q9Y2Q5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR2Q9Y2Q5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR2Q9Y2Q5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR2Q9Y2Q5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR2Q9Y2Q5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
LAMTOR2Q9Y2Q5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
LAMTOR2Q9Y2Q5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMTOR2Q9Y2Q5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms