Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
TRAPPC8Q9Y2L5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms