Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms