Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTF2Q9UNY4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTF2Q9UNY4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms