Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFSF18Q9UNG2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms