Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHTF1Q9UMS5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHTF1Q9UMS5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms