Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EPDR1Q9UM22 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPDR1Q9UM22 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPDR1Q9UM22 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPDR1Q9UM22 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPDR1Q9UM22 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPDR1Q9UM22 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPDR1Q9UM22 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPDR1Q9UM22 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPDR1Q9UM22 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPDR1Q9UM22 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPDR1Q9UM22 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPDR1Q9UM22 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPDR1Q9UM22 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPDR1Q9UM22 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPDR1Q9UM22 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPDR1Q9UM22 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPDR1Q9UM22 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPDR1Q9UM22 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPDR1Q9UM22 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPDR1Q9UM22 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPDR1Q9UM22 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPDR1Q9UM22 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPDR1Q9UM22 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms